طولانی شدن روند ترخیص مواد اولیه برای بخش تولید از گمرک را میتوان یکی از عمده مشکلات این بخش دانست؛ مشکلی که طی سالهای اخیر در برخی مواقع افزایش هزینههای تولید را به همراه داشته و برای عبور از آن راهکارهای بسیاری در نظر گرفته شده، اما عدم بهبود این روند موجب شد تا ماده ۳۸ قانون رفع موانع تولید رقابتپذیر و ارتقای نظام مالی کشور نیز به رفع این چالش اختصاص یابد.